” Jmol” nah apa sih Jmol itu sebenarnya?
Jmol merupakan sofware visualisasi struktur molekul dalam 3D. Jangan khawatir teman-teman
walaupun sangat canggih, aplikasi ini gratis lho, maka dari itu kita harus memanfaatkan aplikasi
ini dengan baik. Oke…
Selain gratis,
aplikasi ini kompatibel
dengan os windows, mac OS X dan linux/unix. Aplikasi ini bisa didownlod di
situs resmi
Setelah diinstal di komputer, saatnya
menggunakan aplikasi ini. Penggunaan utama aplikasi ini kan untuk melihat suatu senyawa secara
tiga dimensi tetapi selain itu kita juga bisa menggambar dengan menggunakan
jmol ini. Untuk melihat suatu senyawa, data base nya bisa di download di pupchem.
Senyawa yang kita butuhkan bisa di peroleh dengan mudah dan gratis. Di pupchem tersebut
hanya tinggal ketik nama senyawa dan di download file dengan tipe .sdf yang
3D-nya ya.
Sekarang kita akan mencoba menggunakan
aplikasi ini. Buka aplikasi Jmol, maka akan muncul tampilan seperti di bawah
ini. Lalu untuk memulai menggambar molekul adalah klik:
Hasilnya adalah:
Kita bisa mengganti sesuai keinginan kita.
Semisal saya mencoba untuk membuat NH3.
Untuk memberi nama pada setiap atom, klik
display lalu klik label dan pilih sesuai yang anda sukai
Nah kita bisa melihat bentuk molekul yang
kita buat secara 3D, dari sisi depan, atas,bawah, kanan, kiri.caranya :
Klik pada menu View
ini contoh melihat pada sisi depan
Kalau yang di bawah ini tampilan tampak dari
bawah:
Nah selamat mencoba teman-teman. Semoga bermanfaat,
amin : 0 : )
http://vici4ict.wordpress.com/2012/12/27/cara-menggunakan-aplikasi-jmol/
http://vici4ict.wordpress.com/2012/12/27/cara-menggunakan-aplikasi-jmol/
0 komentar:
Posting Komentar